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家谱分析

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发表于 2006-11-21 00:00:14 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式

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PEDIGREE ANALYSIS(家谱分析)  基因学家与繁殖者对近亲繁殖之定义是不同的。基因学家把近亲繁殖看作一可测之数字, 每当公犬与母犬双方的家谱中有一个共同品系原型时该数字上升; 繁殖者把近亲繁殖看作封闭式近亲繁殖, 譬如父亲对女儿或兄弟对姐妹之交配。即使在第八代, 一个共同品系原型在这部家谱中会增加该可测近亲繁殖数量。
近亲繁殖系数(或者被称为"怀特系数=> Wright's coefficient) 是所有变化之基因对(gene pairs)百分比的估算. 由于对共同品系原型之继承, 该变化之基因对为纯合。由于对共同品系原型之继承, 任一单独之基因对为纯合机会也是平均的。为确定相对于你的繁殖之一特殊交配是否为远缘繁殖或近亲繁殖, 就须确定该犬种的平均近亲繁殖系数。一犬种的平均近亲繁殖系数会变化, 该变化取决于这一种系的普及性或其种系繁殖数量之年龄范围。基于一个有十代家谱, 近亲繁殖系数为14%的交配, 对于拉布拉多寻血犬来说可被看作适度近亲繁殖(Labrador Retriever=>是一常见种系,它的近亲繁殖系数低); 但对于Irish Water Spaniel(是一稀有种系, 它的近亲繁殖系数较高)该百分比被看作远缘繁殖.

为使家谱的近亲繁殖系数计算准确, 该系数要根据几代谱系求得。在第5还有较近辈份(background inbreeding)中的近亲繁殖经常对由该家谱代表的该后代之基因构成起深刻作用。在对犬种所进行的研究中, 根据四代 对(against) 八代家谱, 近亲繁殖系数上的区别变化巨大。一部包含28个独一无二的品系原型并在这部家谱里占30个位置的四代家谱, 它可以生成一个低近亲繁殖系数; 相同家谱八代血系=>于510个可能位置中包含212个独一无二品系原型, 该家谱有相当高的近亲繁殖系数。在两三代里似远缘基因之混合, 它从在延长的”代”里受到影响的品系原型作为血系内基因之强调出现。
 


这里提出的系数演算过程太复杂。包括于本文结尾列出如何计算系数的几本书; 有些电脑化的犬科家谱程序也可以计算系数。本文中的分析由RCI软件CompuPed执行。

请先自己研究一下这份家谱示例...下次我们要对其展开分析   
 
为使某些概念形象化, 请参考上述家谱。这部家谱中血系内繁殖之品系原型以颜色标注来形象化他们的作用。祖父 -> CH Loch Adair Firefly WD, 和祖母grandam -> CH Loch Adair Firefly WD, 它们完全是兄妹~~ 姑表亲吧!。该姑表亲联姻之近亲繁殖系数是6.25%, 可看作轻度近亲繁殖。根据不同类型的联姻, 在名单上的近亲繁殖系数如下表所示。
交配类型~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~近亲繁殖系数~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~所列出品系原型的血缘百分比
父母 x 子女 25.00% 父母 75.0%
兄弟 x 姊妹 25.00% 共同祖父母 50.0%
父 x 孙女 12.50% 父 62.5%
½兄弟 x ½姊妹 12.50% 共同祖父母 50.0%
叔 x 侄女 12.50% 共同祖父母 37.5%
首次表亲联姻 6.25% 共同曾祖父母 25.0%
 
在Bilye的家谱中, 四代之近亲繁殖系数计算到7.81% 。从首次表亲联姻之估算看 没有很大差异。基于增长中”代”的数字近亲繁殖系数如下: 5代 -> 13.34%; 6代 -> 18.19%; 7代 -> 22.78%; 8代 -> 24.01%; 10代 -> 28.63% 及12代 -> 30.81% 。比你在父母对子女联姻所要看到的(25%), 该近亲繁殖系数30.81百分点更多些。你会看到, 幕后的近亲繁殖较首次表亲联姻对总近亲繁殖系数有着更多作用, 表象更强。
 
除非知道谁的基因强, 于一家谱中近亲繁殖程度的知识给不了你什么必要的帮助。血缘系数之百分比测量在由这部家谱所代表的品系原型和个体之间的关联性。它估算从一个共同品系原型传递下来基因的可能百分点。我们知道父母传递其平均50%的基因, 祖父母传25%, 曾祖父母12.5%~~等等。在该家谱中这个品系原型每次出现, 其传递基因的百分比可能被累加, 其"血缘百分比"被估算出。
 
在许多犬种中, 一具影响力的个体只能在较新的”代”里才会呈现. 然而随后将多次呈现, 以致于该个体对这部家谱大部分之基因起了必要的作用。这会发生于所有犬种 -> 由于丰富的品系原型(通常为种犬), 或一小数量犬群生成之新犬种。根据25代之Bilye家谱, 只有852个独一无二的品系原型 -> 它们共计出现超过二百万次。
Laurel Hill Braxfield Bilye的家谱分析(计算至25代) ==>见附图

 
上述分析显示在Bilye的家谱中品系原型(->祖先)之作用 – 血系内的共同祖先特征。以颜色标注的犬是在5代家谱内显示的。CH Afternod Drambuie在血系内共同祖先特征中拥有全部最高基因 ->起重要作用。他在第6和第8代之间出现33次。一次出现在第6代, 给了这部家谱1.56%基因。他共拿出Bilye基因的33.2%,其次只对父母。所以, 在这部家谱中, 最具影响的品系原型特征在5代家谱甚至都不曾出现。他的生母 CH Afternod Sue在第7和第10代之间出现61次, 在家谱里她比祖父母献出的基因还要多。

形成Gordon Setter犬种的基础犬在现代犬基因构成中扮演一个巨大角色。. 在第16和第25代之间Heather Grouse出现超过百万次, 并且几乎在第25代之外加倍那些出现。其作用超过对Bilye之血统基因的10%。这个例子表明家谱的层深对估计个体的基因构成非常重要。由Heather Grouse 或其它基础犬携带de任何有害隐性基因, 可以说普遍在犬种中存在。
2#
发表于 2006-11-30 14:45:36 | 只看该作者
:Smilies10
3#
发表于 2008-1-10 11:30:44 | 只看该作者
顶~~
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